Naast het feit dat Imuran slechts door 1 op 3 patiënten verdragen wordt, zijn er ook heel wat bijwerkingen (zeker na langdurige inname van Imuran). Niet iedereen heeft alle bijwerkingen en in dezelfde mate:

• De medicatie heeft een invloed op de bloedsamenstelling: je maakt minder witte bloedcellen aan en je hebt meer bloedplaatjes. Door dit alles moet het bloed vaak gecontroleerd worden: in het begin om de 2 weken, later als men weet dat je de medicatie goed verdraagt, hoeft het maar 2 keer per jaar. De gewijzigde bloedsamenstelling kan leiden tot bloedarmoede in sommige gevallen. Verder heb je ook gemakkelijk blauwe plekken. 
• Tijdens de eerste maanden kan je een alvleesklierontsteking (pancreatitis) krijgen. Geen reden tot paniek, want je arts zal dit in de beginperiode nauwlettend in het oog houden via bloedonderzoek. Als je een alvleesklierontsteking zou krijgen, dient de medicatie wel stopgezet te worden en mag je het ook later niet meer krijgen.
• Lichte haaruitval: dit gebeurt niet bij iedereen en is maar tijdelijk.
• Huidproblemen: vooral acné, afschilvering van de huid en het slecht genezen van wondjes.
• Pijn in de gewrichten.
  
  

Let ook op om niet te veel in de vlakke zon te komen. Men heeft vaak een zonneallergie door het gebruik van Imuran/Azathioprine met pijnlijke of jeukerige huiduitslag tot gevolg. Bescherm je huid met een zonnecrème die voldoende beschermt voordat je in de zon gaat.

Imuran werkt pas na een 3 maand. Daarom wordt bij de opstart vaak tijdelijk nog een ander medicijn gegeven. Ook als je stopt met Imuran (vb overschakeling naar een ander medicijn), zal Imuran nog een tijdje actief zijn in je lichaam.
Voor vrouwen die zwanger wensen te worden: bespreek dit best tijdig met je arts. Je arts kan best adviseren voor jouw situatie wat het beste is: verder Imuran gebruiken of er tijdig mee stoppen.